Программное средство Cissearch для анализа данных генной экспрессии: Поиск регуляторных факторов, зависящих от генной экспрессии

СisSearch необходим для предсказания ключевых регуляторных молекул и создания новых комплексных лекарственных средств.

  • Большинство трудноизлечимых заболеваний имеют комплексную структуру.
  • Необходимо предсказание регуляторной модели на основе биологических данных пользователя.
  • Программный комплекс CisSearchT позволяет сократить временные и финансовые издержки при разработке лекарств.

Пакет Сissearch, написан на C++ и на данный момент представляет собой приложение с графическим интерфейсом, позволяющим обрабатывать различные типы данных: последовательности ДНК, гомологи, данные микрочиповых экспериментов, пути передачи сигналов.

Для анализа указанных данных используется пять алгоритмов: обработка микрочиповых данных, анализ набора генов, филогенетический футпринт, анализ единичных полиморфизмов и анализ аллелей.

Визуализация результатов анализа биологической информации. Наряду с текстовым выводом результатов реализован графический вывод. Несомненно, графическое представление помогает исследователю наглядно проверить адекватность исходных данных и оценить полученные результаты качественно. В нашем проекте реализовано несколько типов графиков (гистограммы, столбчатые диаграммы), отражающих различные свойства данных и позволяющих провести их анализ. В результате обработки микрочипов, а также набора промоторов и клинических показаний (набора аллелей) строятся графики, представленные ниже.




Вы обнаружили ошибку в следующем тексте:
Просто нажмите кнопку "Отправить сообщение об ошибке" для завершения. Вы можете также ввести комментарий (желательно).