Анализ генетических последовательностей

1. Визуализация генетических данных

Генной последовательности, представляющей собой последовательность букв очень большой длины, сопоставляются различными способами числовые последовательности, т.е. сигналы. Частям числовых последовательностей сопоставляются изображения, т.е. производится их визуализация. Последовательности изображений объединяются в фильмы. В итоге возникает возможность, просматривая фильм, останавливать его на том или ином интересном месте и анализировать данный участок генной последовательности. Такой подход является целесообразным, ввиду больших объемов информации.

2. Алгоритмы, основанные на применении весовых матриц

Модифицировались известные, а также разрабатывались и исследовались новые алгоритмы для приложений в области генетики: алгоритмы, основанные на применении весовых матриц, распознавания двойных сайтов, филогенетический футпринт, антифутпринт, алгоритмы анализа группы последовательностей, поиска цис-элементов на основе данных с микрочипов и др. Работа ведется совместно со специалистами из Института цитологии и генетики СО РАН и немецкой компанией Biobase.

3. Алгоритмы, основанные на сравнении с известными кодами

Рассмотрен ряд алгоритмов анализа сигналов, возникающих в генетике. Генной последовательности сопоставляются различными способами числовые последовательности, т.е. сигналы.

Далее становится возможным применения методов обработки сигналов. В частности, исследовались корреляционные функции с сигналами, построенными на основе некоторых известных кодов, типа кодов Баркера и др. Аналогично, работа ведется совместно со специалистами из Института цитологии и генетики СО РАН и немецкой компанией Biobase.




Вы обнаружили ошибку в следующем тексте:
Просто нажмите кнопку "Отправить сообщение об ошибке" для завершения. Вы можете также ввести комментарий (желательно).