Система ExPlain позволяет проводить анализ и
биологическую интерпретацию современных высокотехнологичных экспериментов
(микроарреи, данные протеомики, ChIP-chip эксперименты). Программа позволяет генерировать гипотезы
о регуляции, транскрипции генов, сигнальных путей для экспериментальной
проверки.
Это интерактивное
веб-приложение предоставляет возможности для комплексного анализа
экспериментальных данных, связанных с регуляцией генов, и объединяет в себе
несколько различных разработок. Система написана на языке программирования Perl
с использованием систем управления реляционными базами данных, поддерживающих язык
SQL. На данный момент система работает на платформах Win32 и Linux, и в
качестве СУБД может использовать MySQL.
Можно выделить
основные элементы интерфейса. Во-первых, это меню, позоволяющее выполнять
загрузку и обработку данных, запускать различные виды анализа. Во-вторых,
диалоговые окна, где можно задать параметры анализа и запустить его. Затем блок
информации о запущенных процессах (справа от меню), где отображается, какие
процессы выполняются, какие находятся в состоянии ожидания и какие выполнены.
Наконец, нижняя часть состоит из дерева объектов (слева) и рабочей области
(справа), где, как правило, отображается объект, выбранный в дереве.
